При работе с базой паролей в программе KeePass, любые изменения следует сохранять (по аналогии работы с документами Word, Excel и т.д.).

1. Для ручного варианта сохранения изменений необходимо нажать на кнопку в виде дискеты "Save" (если она "серая", то это значит, что изменения не вносились). Так же работают быстрая комбинация клавиш "Ctrl+S" и меню 'File' → 'Save'.
   
2. Можно включить автосохранение при закрытии/блокировке базы, для этого необходимо перейти в 'Tools' → 'Options'
   
   и во вкладке "Advanced" активировать функцию "Automatically save when closing/locking the database", нажать кнопку "Ok".
   
3. Совместно с включенной настройкой из п.2, можно добавить блокировку открытой базы через указанное время, тем самым осуществить ее автосохранение. Для этого так же переходим в 'Tools' → 'Options' и во вкладке "Security" активируем функцию "Lock workspace after global user inactivity", указываем 300 сек. (5 мин.), нажимаем кнопку "Ok". В результате, база паролей сохранит внесенные изменения и заблокируется по истечении 5 мин. бездействия на компьютере.